因为鼻咽的位置很特殊，所以切除手术很难做，而且风险也很大。幸运的是，鼻咽癌对放疗很敏感，所以现在放疗是治疗鼻咽癌最主要的方法。在病变早期，单纯放疗的效果非常显著。在中晚期，通常采用同步放化疗作为主要的治疗模式。此外，中西医结合治疗鼻咽癌也得到了越来越多患者和医生的认可。

中医认为，鼻咽癌的主要原因是人体气血阴阳亏虚，无法抵御外邪。鼻咽是气进入人体的主要通道，随着呼吸而动，最容易感受到毒邪。而鼻咽高居在人的头部，正气不足的人难以推动气血津液滋润，使得邪气盘踞，日久就化为了癌肿。鼻咽癌在南方特别容易发生，这主要和南方沿海地区的气候潮湿炎热、人们的饮食习惯（比如喜欢吃腌制、熏制食物）以及不良的生活习惯（比如晚睡）有关。

在临床上，找中医治疗的鼻咽癌患者多数是在放化疗之后。马大军主任认为，放射治疗所用的射线属于热毒之邪，会很容易伤阴耗气，而肿瘤病人本来就已经气血亏虚，津液不足，所以鼻咽癌放化疗后“阴虚”的表现比较明显，以“气阴两虚证”较为常见。治疗上主要以益气养阴、清热解毒、化痰散结为主。

常用的经验方是：太子参、黄芪、灵芝、生地、麦冬、元参、白花蛇舌草、半边莲、半枝莲、桔梗、法半夏、陈皮、甘草。

如果在放疗期间或放疗后出现咽痛，可以使用射干、牛蒡子、桔梗等；如果出现涕血，可以酌用侧柏叶、仙鹤草、白茅根等；如果鼻塞多涕，可以使用白芷、辛夷、苍耳子等；如果出现恶心呕吐，可以使用竹茹、吴茱萸、砂仁等；如果出现头痛，可以使用天麻、钩藤、川芎等。

中医治疗可以贯穿于鼻咽癌的整个治疗过程。对于完成了放化疗而病情稳定的患者，或者经过西医治疗后肿瘤控制不佳有残留的患者，或者仅有EB病毒高水平的患者，都可以在辨证施治的基础上使用清热解毒、化痰散结的抗肿瘤中药，以杀灭残留的癌细胞或抑制EB病毒。